北京协和医院眼科成立于1920年，是我国最早成立的眼科。成立后许多国际一流的眼科学家曾在这里主持工作，被誉为“东方的维也纳眼科中心”。经过90年的发展，协和眼科成为专业齐全，融医、教、研为一体的眼科基地，整体水平在国内处于领先地位，一些项目达国际先进水平。协和眼科是国内首批硕士、博士学位培养点和博士后流动站，首批住院医师规范化培训基地。
协和眼科目前拥有东单和西单两个诊区，眼科病房设在东单协和，共有床位49张。协和眼科设有眼底病、青光眼、角膜和屈光、神经眼科、葡萄膜炎、斜视和弱视、眼眶和整形、眼遗传、眼科流行病与防盲专业学组，还设有眼科实验室供临床和研究使用。现任科主任为钟勇教授、陈有信教授和张美芬教授，主任助理张顺华副教授。
协和眼科在各个专业领域内都有经验丰富的知名专家为来自全国各地的疑难眼病患者服务。随着2012年协和新门诊楼和新外科大楼的使用，配备了与世界一流眼科中心接轨的诊疗设备，协和眼科的诊疗环境大幅提升。目前协和眼科开设有普通门诊（东单和西单院区）、专科门诊、特需门诊和国际门诊，满足患者对医疗的多层次需求，年门诊量12万人次以上。协和眼科开展玻璃体视网膜手术、飞秒激光矫正近视手术、白内障摘除手术、有晶体眼人工晶体植入手术、斜视矫正术、眼整形手术等各类眼科手术，年手术量超过8000台。此外协和眼科还出色完成国家及国家卫生计生委的支边扶贫、援疆援藏、援非、援澳等医疗任务。
目前协和眼科在眼底病、青光眼、角膜屈光、神经眼科、葡萄膜炎等专业均为国内公认的优势专业：
眼底病学组：眼底病学组是眼科最早成立的专科之一，在眼底病诊治方面做了很多创新性工作，如糖尿病视网膜病变的诊治、眼底血管造影及激光治疗、视网膜移植、玻璃体切除手术等。目前的眼底病组是一个老中青相结合而又充满朝气的团队。眼底病专家如董方田、叶俊杰、陈有信、谭柯等经验丰富，年轻的眼底病医生如戴荣平、于伟泓等在临床和科研方面也有不俗的表现。。
青光眼学组：青光眼学组是眼科最早成立的专科之一。在胡铮教授、赵家良教授、李静贞教授等几代著名青光眼专家的引领下，协和青光眼团队在我国的各类型青光眼的流行病学研究、早期筛查、早期诊断、综合治疗等方面不断进行开创性、引领性工作，奠定了协和青光眼学组国内领先的学术地位。目前，青光眼专业组具有各项完善的国际先进的检查和治疗设备，建立了成熟的青光眼筛查、诊断、治疗及随访体系。在各型闭角型青光眼的诊治方面，形成了成熟的具有协和特色的筛查诊断标准、治疗策略和治疗方法，在国内处于领先水平。在各型开角型青光眼的诊治方面，建立了基于立体视神经照相的检查随访策略、诊断分级标准，完善了基于最新型激光治疗、新型非穿通微创手术、改良小梁切除手术、引流物植入术、新型抗青光眼药物治疗的整合性及个体化治疗体系。青光眼组具备各类型难治性青光眼的治疗经验，并开创了以微创内路滤过道再通术等新型技术为基础的挽救性治疗，重建失败滤过道的功能通路。
角膜病及屈光学组：协和屈光角膜专业组是我国最早开展准分子激光治疗屈光不正、巩膜激光(ACE)治疗老化的多项手术的单位。也是中华医学会眼科角膜病学组副组长单位和亚洲干眼学会、亚洲角膜病学会委员单位。专业组几十年一直重视梯队建设和人才培养，目前学组带头人为李莹教授，李莹教授是角膜病和屈光手术专家，博士生导师，中华医学会眼科角膜病学组副组长，龙琴副教授、罗岩副教授、王忠海医生也分别在角膜疾病和屈光手术方面具有丰富经验。协和眼科拥有国家批准的最早的眼库。是全国疑难角膜疾病会诊中心，拥有世界上最先进的近视激光手术设备，能开展各项屈光手术，包括全飞秒激光、飞秒激光辅助的LASIK（半飞秒）、LASIK、全激光Trans-PRK、LASEK、SBK、PRK、PTK等，可以为不同需求者进行个性设计；还开展眼内有晶体眼人工晶体植入高度近视手术，以及屈光手术后严重并发症的诊断与治疗。多年来培养了几十名硕士、博士研究生，并承担国家继续教育项目和负责全国准分子激光医技人员上岗培训工作，为国内多家近视治疗中心提供业务指导，深受同行及患者的信赖。本专业组为了更好地服务患者，各种激光近视手术随时加号检查，尽快预约手术；重症角膜炎、角膜溃疡可以直接到门诊加号。
神经眼科学组：神经眼科是一门多学科相关的交叉学科，学组最早由劳远琇教授在全国最先创立，现由钟勇教授全面主持。学组长期致力于神经眼科领域的基础及临床研究，对缺血性视神经病变、不同病因引起的视神经炎、鞍区病变的神经损害等疾病具有丰富的诊治经验，该专业组成为全国神经眼科疑难疾病的诊疗中心。
葡萄膜炎学组：葡萄膜炎学组成立于1983年，系国内最早成立的葡萄膜炎专科之一。经过30余年的积累，葡萄膜炎的临床诊疗及科研水平在国内位居前列，接诊大量全国各地转诊而来的重症疑难患者，尤其是原田小柳病、白塞病、儿童葡萄膜炎、各种感染性葡萄膜炎（如急性视网膜坏死、结核性葡萄膜炎）、原发性眼内淋巴瘤等。专业组注重团队建设，已建立了临床和科研能力兼优的人才梯队，在协和综合优势的平台上，高水平的完成葡萄膜炎的诊断及治疗。
眼肌屈光学组：主要针对眼斜视、弱视及屈光不正患者提供诊疗方案，除了对常见的斜、弱视患者的诊治外，学组还不断探讨复杂斜视、儿童弱视、屈光不正、甲状腺相关眼病等疑难疾患的发病机制及防治手段，尤其对重度甲状腺相关眼病的发病机理及防治方面有着较为深入的研究。多年来学组也致力于青少年近视的发生及发展机制的研究，以及各种预防措施的实施。协和眼科拥有经验丰富的眼光师可以提供医学验光，并配有配镜中心，提供各种类型的框架镜、角膜接触镜以及儿童角膜塑形镜。
眼整形学组：眼部整形美容专业关注于眼部的整形、美容手术，收费低、效果好、性价比全国最高，重睑手术不足千元。目前眼整形学组常规开展的项目包括：1、美容手术：双重睑手术（包括全切开、埋线和微创重睑手术），眼袋手术（包括内切口眼袋和外切口眼袋手术），内眦赘皮矫正（开眼角），外眦开大手术等；2、整形手术包括：上睑下垂、泪腺脱垂、眼睑内翻和外翻、眼部肿瘤切除术后整形、结膜囊成型、睑球粘连分离、甲状腺相关性眼病所致上睑、下睑退缩等；3、眼眶手术：眼眶骨折复位，甲亢突眼眶减压手术，眶内肿瘤等；4、泪道手术：结膜松驰、泪小点狭窄、泪道阻塞、慢性泪囊炎等疾病的手术治疗。
眼遗传及电生理学组：北京协和医院眼科视觉电生理与遗传学组是我国最早成立的眼科亚专科，目前国内领先。主要医疗和科研领域为遗传性眼病、先天眼部异常、累及眼病的全身综合征和疑难病。学组在国际上首次报道了多种视网膜变性的临床特征及中国特殊的基因突变普。
协和眼科目前拥有东单和西单两个诊区，眼科病房设在东单协和，共有床位49张。协和眼科设有眼底病、青光眼、角膜和屈光、神经眼科、葡萄膜炎、斜视和弱视、眼眶和整形、眼遗传、眼科流行病与防盲专业学组，还设有眼科实验室供临床和研究使用。现任科主任为钟勇教授、陈有信教授和张美芬教授，主任助理张顺华副教授。
协和眼科在各个专业领域内都有经验丰富的知名专家为来自全国各地的疑难眼病患者服务。随着2012年协和新门诊楼和新外科大楼的使用，配备了与世界一流眼科中心接轨的诊疗设备，协和眼科的诊疗环境大幅提升。目前协和眼科开设有普通门诊（东单和西单院区）、专科门诊、特需门诊和国际门诊，满足患者对医疗的多层次需求，年门诊量12万人次以上。协和眼科开展玻璃体视网膜手术、飞秒激光矫正近视手术、白内障摘除手术、有晶体眼人工晶体植入手术、斜视矫正术、眼整形手术等各类眼科手术，年手术量超过8000台。此外协和眼科还出色完成国家及国家卫生计生委的支边扶贫、援疆援藏、援非、援澳等医疗任务。
目前协和眼科在眼底病、青光眼、角膜屈光、神经眼科、葡萄膜炎等专业均为国内公认的优势专业：
眼底病学组：眼底病学组是眼科最早成立的专科之一，在眼底病诊治方面做了很多创新性工作，如糖尿病视网膜病变的诊治、眼底血管造影及激光治疗、视网膜移植、玻璃体切除手术等。目前的眼底病组是一个老中青相结合而又充满朝气的团队。眼底病专家如董方田、叶俊杰、陈有信、谭柯等经验丰富，年轻的眼底病医生如戴荣平、于伟泓等在临床和科研方面也有不俗的表现。。
青光眼学组：青光眼学组是眼科最早成立的专科之一。在胡铮教授、赵家良教授、李静贞教授等几代著名青光眼专家的引领下，协和青光眼团队在我国的各类型青光眼的流行病学研究、早期筛查、早期诊断、综合治疗等方面不断进行开创性、引领性工作，奠定了协和青光眼学组国内领先的学术地位。目前，青光眼专业组具有各项完善的国际先进的检查和治疗设备，建立了成熟的青光眼筛查、诊断、治疗及随访体系。在各型闭角型青光眼的诊治方面，形成了成熟的具有协和特色的筛查诊断标准、治疗策略和治疗方法，在国内处于领先水平。在各型开角型青光眼的诊治方面，建立了基于立体视神经照相的检查随访策略、诊断分级标准，完善了基于最新型激光治疗、新型非穿通微创手术、改良小梁切除手术、引流物植入术、新型抗青光眼药物治疗的整合性及个体化治疗体系。青光眼组具备各类型难治性青光眼的治疗经验，并开创了以微创内路滤过道再通术等新型技术为基础的挽救性治疗，重建失败滤过道的功能通路。
角膜病及屈光学组：协和屈光角膜专业组是我国最早开展准分子激光治疗屈光不正、巩膜激光(ACE)治疗老化的多项手术的单位。也是中华医学会眼科角膜病学组副组长单位和亚洲干眼学会、亚洲角膜病学会委员单位。专业组几十年一直重视梯队建设和人才培养，目前学组带头人为李莹教授，李莹教授是角膜病和屈光手术专家，博士生导师，中华医学会眼科角膜病学组副组长，龙琴副教授、罗岩副教授、王忠海医生也分别在角膜疾病和屈光手术方面具有丰富经验。协和眼科拥有国家批准的最早的眼库。是全国疑难角膜疾病会诊中心，拥有世界上最先进的近视激光手术设备，能开展各项屈光手术，包括全飞秒激光、飞秒激光辅助的LASIK（半飞秒）、LASIK、全激光Trans-PRK、LASEK、SBK、PRK、PTK等，可以为不同需求者进行个性设计；还开展眼内有晶体眼人工晶体植入高度近视手术，以及屈光手术后严重并发症的诊断与治疗。多年来培养了几十名硕士、博士研究生，并承担国家继续教育项目和负责全国准分子激光医技人员上岗培训工作，为国内多家近视治疗中心提供业务指导，深受同行及患者的信赖。本专业组为了更好地服务患者，各种激光近视手术随时加号检查，尽快预约手术；重症角膜炎、角膜溃疡可以直接到门诊加号。
神经眼科学组：神经眼科是一门多学科相关的交叉学科，学组最早由劳远琇教授在全国最先创立，现由钟勇教授全面主持。学组长期致力于神经眼科领域的基础及临床研究，对缺血性视神经病变、不同病因引起的视神经炎、鞍区病变的神经损害等疾病具有丰富的诊治经验，该专业组成为全国神经眼科疑难疾病的诊疗中心。
葡萄膜炎学组：葡萄膜炎学组成立于1983年，系国内最早成立的葡萄膜炎专科之一。经过30余年的积累，葡萄膜炎的临床诊疗及科研水平在国内位居前列，接诊大量全国各地转诊而来的重症疑难患者，尤其是原田小柳病、白塞病、儿童葡萄膜炎、各种感染性葡萄膜炎（如急性视网膜坏死、结核性葡萄膜炎）、原发性眼内淋巴瘤等。专业组注重团队建设，已建立了临床和科研能力兼优的人才梯队，在协和综合优势的平台上，高水平的完成葡萄膜炎的诊断及治疗。
眼肌屈光学组：主要针对眼斜视、弱视及屈光不正患者提供诊疗方案，除了对常见的斜、弱视患者的诊治外，学组还不断探讨复杂斜视、儿童弱视、屈光不正、甲状腺相关眼病等疑难疾患的发病机制及防治手段，尤其对重度甲状腺相关眼病的发病机理及防治方面有着较为深入的研究。多年来学组也致力于青少年近视的发生及发展机制的研究，以及各种预防措施的实施。协和眼科拥有经验丰富的眼光师可以提供医学验光，并配有配镜中心，提供各种类型的框架镜、角膜接触镜以及儿童角膜塑形镜。
眼整形学组：眼部整形美容专业关注于眼部的整形、美容手术，收费低、效果好、性价比全国最高，重睑手术不足千元。目前眼整形学组常规开展的项目包括：1、美容手术：双重睑手术（包括全切开、埋线和微创重睑手术），眼袋手术（包括内切口眼袋和外切口眼袋手术），内眦赘皮矫正（开眼角），外眦开大手术等；2、整形手术包括：上睑下垂、泪腺脱垂、眼睑内翻和外翻、眼部肿瘤切除术后整形、结膜囊成型、睑球粘连分离、甲状腺相关性眼病所致上睑、下睑退缩等；3、眼眶手术：眼眶骨折复位，甲亢突眼眶减压手术，眶内肿瘤等；4、泪道手术：结膜松驰、泪小点狭窄、泪道阻塞、慢性泪囊炎等疾病的手术治疗。
眼遗传及电生理学组：北京协和医院眼科视觉电生理与遗传学组是我国最早成立的眼科亚专科，目前国内领先。主要医疗和科研领域为遗传性眼病、先天眼部异常、累及眼病的全身综合征和疑难病。学组在国际上首次报道了多种视网膜变性的临床特征及中国特殊的基因突变普。